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  • Artigo de periodico

    Oxidation of propionate in Pseudomonas sp. LFM046: relevance to the synthesis of polyhydroxyalkanoates containing odd-chain length monomers and 2-methylisocitrate (2024)

    Santos-Oliveira, Pedro Henrique ; Machado, Nathalia Fernandes Gonçalves; Oliveira, Rafael David de ; Blank, Lars Mathias ; Carrillo Le Roux, Galo Antonio ; Silva, Luiziana Ferreira da ; Gomez, José Gregório Cabrera

    Source: Bioresource Technology. Unidades: EP, ICB, BIOTECNOLOGIA

    Subjects: MICROBIOLOGIA, OXIDAÇÃO, HIDROXIÁCIDOS, PSEUDOMONAS, POLIÉSTER

    Acesso à fonteDOIHow to cite
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    • ABNT

      SANTOS-OLIVEIRA, Pedro Henrique et al. Oxidation of propionate in Pseudomonas sp. LFM046: relevance to the synthesis of polyhydroxyalkanoates containing odd-chain length monomers and 2-methylisocitrate. Bioresource Technology, v. 391, p. 10 , 2024Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.biortech.2023.129944. Acesso em: 09 maio 2024.

    • APA

      Santos-Oliveira, P. H., Machado, N. F. G., Oliveira, R. D. de, Blank, L. M., Carrillo Le Roux, G. A., Silva, L. F. da, & Gomez, J. G. C. (2024). Oxidation of propionate in Pseudomonas sp. LFM046: relevance to the synthesis of polyhydroxyalkanoates containing odd-chain length monomers and 2-methylisocitrate. Bioresource Technology, 391, 10 . doi:10.1016/j.biortech.2023.129944

    • NLM

      Santos-Oliveira PH, Machado NFG, Oliveira RD de, Blank LM, Carrillo Le Roux GA, Silva LF da, Gomez JGC. Oxidation of propionate in Pseudomonas sp. LFM046: relevance to the synthesis of polyhydroxyalkanoates containing odd-chain length monomers and 2-methylisocitrate [Internet]. Bioresource Technology. 2024 ; 391 10 .[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.biortech.2023.129944

    • Vancouver

      Santos-Oliveira PH, Machado NFG, Oliveira RD de, Blank LM, Carrillo Le Roux GA, Silva LF da, Gomez JGC. Oxidation of propionate in Pseudomonas sp. LFM046: relevance to the synthesis of polyhydroxyalkanoates containing odd-chain length monomers and 2-methylisocitrate [Internet]. Bioresource Technology. 2024 ; 391 10 .[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.biortech.2023.129944

  • Trabalho de evento-anais periodico

    Parameter estimation in dynamic metabolic models applying a surrogate approximation (2022)

    Oliveira, Rafael David de ; Procópio, Dielle Pierotti ; Basso, Thiago Olitta ; Carrillo Le Roux, Galo Antonio

    Source: Computer Aided Chemical Engineering. Conference titles: European Symposium on Computer Aided Process Engineering. Unidades: EP, IQ

    Subjects: METABOLISMO, MODELAGEM DE DADOS

    PrivadoAcesso à fonteDOIHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      OLIVEIRA, Rafael David de et al. Parameter estimation in dynamic metabolic models applying a surrogate approximation. Computer Aided Chemical Engineering. Amsterdam: Escola Politécnica, Universidade de São Paulo. Disponível em: https://doi.org/10.1016/B978-0-323-95879-0.50036-9. Acesso em: 09 maio 2024. , 2022

    • APA

      Oliveira, R. D. de, Procópio, D. P., Basso, T. O., & Carrillo Le Roux, G. A. (2022). Parameter estimation in dynamic metabolic models applying a surrogate approximation. Computer Aided Chemical Engineering. Amsterdam: Escola Politécnica, Universidade de São Paulo. doi:10.1016/B978-0-323-95879-0.50036-9

    • NLM

      Oliveira RD de, Procópio DP, Basso TO, Carrillo Le Roux GA. Parameter estimation in dynamic metabolic models applying a surrogate approximation [Internet]. Computer Aided Chemical Engineering. 2022 ; 51 211-216.[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://doi.org/10.1016/B978-0-323-95879-0.50036-9

    • Vancouver

      Oliveira RD de, Procópio DP, Basso TO, Carrillo Le Roux GA. Parameter estimation in dynamic metabolic models applying a surrogate approximation [Internet]. Computer Aided Chemical Engineering. 2022 ; 51 211-216.[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://doi.org/10.1016/B978-0-323-95879-0.50036-9

  • Tese (Doutorado)

    Numerical methods for metabolic network models (2022)

    Oliveira, Rafael David de ; Carrillo Le Roux, Galo Antonio (Orientador)

    Unidade: EP

    Subjects: BIOPROCESSOS, CONTROLE PREDITIVO

    Acesso à fonteHow to cite
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    • ABNT

      OLIVEIRA, Rafael David de. Numerical methods for metabolic network models. 2022. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3137/tde-05072023-111915/. Acesso em: 09 maio 2024.

    • APA

      Oliveira, R. D. de. (2022). Numerical methods for metabolic network models (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3137/tde-05072023-111915/

    • NLM

      Oliveira RD de. Numerical methods for metabolic network models [Internet]. 2022 ;[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3137/tde-05072023-111915/

    • Vancouver

      Oliveira RD de. Numerical methods for metabolic network models [Internet]. 2022 ;[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3137/tde-05072023-111915/

  • Artigo de periodico

    Glucose metabolism in Pseudomonas aeruginosa is cyclic when producing Polyhydroxyalkanoates and Rhamnolipids (2021)

    Oliveira, Rafael David de ; Novello, Vânia ; Silva, Luiziana Ferreira da ; Gomez, José Gregório Cabrera ; Roux, Galo Antonio Carrillo Le

    Source: Journal of Biotechnology. Unidades: ICB, EP, BIOTECNOLOGIA

    Subjects: MICROBIOLOGIA, POLIÉSTER, PLÁSTICOS BIODEGRADÁVEIS, DETERGENTES, METABOLISMO, BIOPOLÍMEROS, OXIDAÇÃO, GLICOSE, FOSFATOS, ISÓTOPOS, GLICOLIPÍDEOS

    PrivadoAcesso à fonteDOIHow to cite
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    • ABNT

      OLIVEIRA, Rafael David de et al. Glucose metabolism in Pseudomonas aeruginosa is cyclic when producing Polyhydroxyalkanoates and Rhamnolipids. Journal of Biotechnology, v. 342, p. 54-63, 2021Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.jbiotec.2021.10.007. Acesso em: 09 maio 2024.

    • APA

      Oliveira, R. D. de, Novello, V., Silva, L. F. da, Gomez, J. G. C., & Roux, G. A. C. L. (2021). Glucose metabolism in Pseudomonas aeruginosa is cyclic when producing Polyhydroxyalkanoates and Rhamnolipids. Journal of Biotechnology, 342, 54-63. doi:10.1016/j.jbiotec.2021.10.007

    • NLM

      Oliveira RD de, Novello V, Silva LF da, Gomez JGC, Roux GACL. Glucose metabolism in Pseudomonas aeruginosa is cyclic when producing Polyhydroxyalkanoates and Rhamnolipids [Internet]. Journal of Biotechnology. 2021 ; 342 54-63.[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.jbiotec.2021.10.007

    • Vancouver

      Oliveira RD de, Novello V, Silva LF da, Gomez JGC, Roux GACL. Glucose metabolism in Pseudomonas aeruginosa is cyclic when producing Polyhydroxyalkanoates and Rhamnolipids [Internet]. Journal of Biotechnology. 2021 ; 342 54-63.[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.jbiotec.2021.10.007

  • Trabalho de evento-anais periodico

    Adaptation of a genome-scale metabolic model to study Saccharomyces cerevisiae anaerobic metabolism (2019)

    Procópio, Dielle Pierotti ; Oliveira, Rafael David de ; Carrillo Le Roux, Galo Antonio ; Basso, Thiago Olitta

    Source: Anais do Simpósio Nacional de Bioprocessos. Conference titles: Simpósio Nacional de Bioprocessos. Unidade: EP

    Subjects: ETANOL, LEVEDURAS, SACCHAROMYCES

    Acesso à fonteHow to cite
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    • ABNT

      PROCÓPIO, Dielle Pierotti et al. Adaptation of a genome-scale metabolic model to study Saccharomyces cerevisiae anaerobic metabolism. Anais do Simpósio Nacional de Bioprocessos. Sao Paulo: Galoá. Disponível em: https://proceedings.science/sinaferm/sinaferm-sheb-2019/papers/adaptation-of-a-genome-scale-metabolic-model-to-study-saccharomyces-cerevisiae-anaerobic-metabolism. Acesso em: 09 maio 2024. , 2019

    • APA

      Procópio, D. P., Oliveira, R. D. de, Carrillo Le Roux, G. A., & Basso, T. O. (2019). Adaptation of a genome-scale metabolic model to study Saccharomyces cerevisiae anaerobic metabolism. Anais do Simpósio Nacional de Bioprocessos. Sao Paulo: Galoá. Recuperado de https://proceedings.science/sinaferm/sinaferm-sheb-2019/papers/adaptation-of-a-genome-scale-metabolic-model-to-study-saccharomyces-cerevisiae-anaerobic-metabolism

    • NLM

      Procópio DP, Oliveira RD de, Carrillo Le Roux GA, Basso TO. Adaptation of a genome-scale metabolic model to study Saccharomyces cerevisiae anaerobic metabolism [Internet]. Anais do Simpósio Nacional de Bioprocessos. 2019 ;[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://proceedings.science/sinaferm/sinaferm-sheb-2019/papers/adaptation-of-a-genome-scale-metabolic-model-to-study-saccharomyces-cerevisiae-anaerobic-metabolism

    • Vancouver

      Procópio DP, Oliveira RD de, Carrillo Le Roux GA, Basso TO. Adaptation of a genome-scale metabolic model to study Saccharomyces cerevisiae anaerobic metabolism [Internet]. Anais do Simpósio Nacional de Bioprocessos. 2019 ;[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://proceedings.science/sinaferm/sinaferm-sheb-2019/papers/adaptation-of-a-genome-scale-metabolic-model-to-study-saccharomyces-cerevisiae-anaerobic-metabolism

  • Trabalho de evento-resumo periodico

    13C-Metabolic flux analysis reveals an entner-doudoroff pathway cyclic mode in simultaneous production of polyhydroxyalkanoates and rhamnolipids by pseudomonas aeruginosa LFM634 (2019)

    Oliveira, Rafael David de ; Novello, Vânia ; Gomez, José Gregório Cabrera ; Carrillo Le Roux, Galo Antonio

    Source: Anais do Simpósio Nacional de Bioprocessos. Conference titles: Simpósio Nacional de Bioprocessos. Unidades: EP, BIOTECNOLOGIA

    Subjects: ESPECTROMETRIA, ENZIMAS, GLICOSE

    Acesso à fonteHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      OLIVEIRA, Rafael David de et al. 13C-Metabolic flux analysis reveals an entner-doudoroff pathway cyclic mode in simultaneous production of polyhydroxyalkanoates and rhamnolipids by pseudomonas aeruginosa LFM634. Anais do Simpósio Nacional de Bioprocessos. Sao Paulo: Galoá. Disponível em: https://proceedings.science/sinaferm/sinaferm-sheb-2019/papers/13c-metabolic-flux-analysis-reveals-an-entner-doudoroff-pathway-cyclic-mode-in-simultaneous-production-of-polyhydroxyalk. Acesso em: 09 maio 2024. , 2019

    • APA

      Oliveira, R. D. de, Novello, V., Gomez, J. G. C., & Carrillo Le Roux, G. A. (2019). 13C-Metabolic flux analysis reveals an entner-doudoroff pathway cyclic mode in simultaneous production of polyhydroxyalkanoates and rhamnolipids by pseudomonas aeruginosa LFM634. Anais do Simpósio Nacional de Bioprocessos. Sao Paulo: Galoá. Recuperado de https://proceedings.science/sinaferm/sinaferm-sheb-2019/papers/13c-metabolic-flux-analysis-reveals-an-entner-doudoroff-pathway-cyclic-mode-in-simultaneous-production-of-polyhydroxyalk

    • NLM

      Oliveira RD de, Novello V, Gomez JGC, Carrillo Le Roux GA. 13C-Metabolic flux analysis reveals an entner-doudoroff pathway cyclic mode in simultaneous production of polyhydroxyalkanoates and rhamnolipids by pseudomonas aeruginosa LFM634 [Internet]. Anais do Simpósio Nacional de Bioprocessos. 2019 ;[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://proceedings.science/sinaferm/sinaferm-sheb-2019/papers/13c-metabolic-flux-analysis-reveals-an-entner-doudoroff-pathway-cyclic-mode-in-simultaneous-production-of-polyhydroxyalk

    • Vancouver

      Oliveira RD de, Novello V, Gomez JGC, Carrillo Le Roux GA. 13C-Metabolic flux analysis reveals an entner-doudoroff pathway cyclic mode in simultaneous production of polyhydroxyalkanoates and rhamnolipids by pseudomonas aeruginosa LFM634 [Internet]. Anais do Simpósio Nacional de Bioprocessos. 2019 ;[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://proceedings.science/sinaferm/sinaferm-sheb-2019/papers/13c-metabolic-flux-analysis-reveals-an-entner-doudoroff-pathway-cyclic-mode-in-simultaneous-production-of-polyhydroxyalk

  • Trabalho de evento-anais periodico

    Design ótimo de experimentos empregando carbono marcado em pseudomonas sp. LFM046 (2018)

    Oliveira, Rafael David de ; Gomez, José Gregório Cabrera ; Carrillo Le Roux, Galo Antonio

    Source: Blucher Chemical Engineering Proceedings. Conference titles: Congresso Brasileiro de Engenharia Química. Unidades: EP, BIOTECNOLOGIA

    Subjects: PSEUDOMONAS, METABOLISMO

    Acesso à fonteAcesso à fonteDOIHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      OLIVEIRA, Rafael David de e GOMEZ, José Gregório Cabrera e CARRILLO LE ROUX, Galo Antonio. Design ótimo de experimentos empregando carbono marcado em pseudomonas sp. LFM046. Blucher Chemical Engineering Proceedings. Sao Paulo: Edgard Blucher. Disponível em: https://doi.org/10.5151/cobeq2018-CO.161. Acesso em: 09 maio 2024. , 2018

    • APA

      Oliveira, R. D. de, Gomez, J. G. C., & Carrillo Le Roux, G. A. (2018). Design ótimo de experimentos empregando carbono marcado em pseudomonas sp. LFM046. Blucher Chemical Engineering Proceedings. Sao Paulo: Edgard Blucher. doi:10.5151/cobeq2018-CO.161

    • NLM

      Oliveira RD de, Gomez JGC, Carrillo Le Roux GA. Design ótimo de experimentos empregando carbono marcado em pseudomonas sp. LFM046 [Internet]. Blucher Chemical Engineering Proceedings. 2018 ; 1( 5): 4715-4718.[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://doi.org/10.5151/cobeq2018-CO.161

    • Vancouver

      Oliveira RD de, Gomez JGC, Carrillo Le Roux GA. Design ótimo de experimentos empregando carbono marcado em pseudomonas sp. LFM046 [Internet]. Blucher Chemical Engineering Proceedings. 2018 ; 1( 5): 4715-4718.[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://doi.org/10.5151/cobeq2018-CO.161

  • Trabalho de evento

    Optimization of PHA production by pseudomonas using 13C-Metabolic flux analysis (2018)

    Carrillo Le Roux, Galo Antonio ; Oliveira, Rafael David de ; Novello, Vânia; Gomez, José Gregório Cabrera

    Source: Proceedings. Conference titles: AIChE Annual Meeting. Unidades: EP, ICB, IB

    Subjects: BIOPOLÍMEROS, PSEUDOMONAS, METABOLISMO

    Acesso à fonteHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      CARRILLO LE ROUX, Galo Antonio et al. Optimization of PHA production by pseudomonas using 13C-Metabolic flux analysis. 2018, Anais.. New York: AIChE, 2018. Disponível em: https://www.aiche.org/conferences/aiche-annual-meeting/2018/proceeding/paper/188ay-optimization-pha-production-pseudomonas-using-13c-metabolic-flux-analysis. Acesso em: 09 maio 2024.

    • APA

      Carrillo Le Roux, G. A., Oliveira, R. D. de, Novello, V., & Gomez, J. G. C. (2018). Optimization of PHA production by pseudomonas using 13C-Metabolic flux analysis. In Proceedings. New York: AIChE. Recuperado de https://www.aiche.org/conferences/aiche-annual-meeting/2018/proceeding/paper/188ay-optimization-pha-production-pseudomonas-using-13c-metabolic-flux-analysis

    • NLM

      Carrillo Le Roux GA, Oliveira RD de, Novello V, Gomez JGC. Optimization of PHA production by pseudomonas using 13C-Metabolic flux analysis [Internet]. Proceedings. 2018 ;[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://www.aiche.org/conferences/aiche-annual-meeting/2018/proceeding/paper/188ay-optimization-pha-production-pseudomonas-using-13c-metabolic-flux-analysis

    • Vancouver

      Carrillo Le Roux GA, Oliveira RD de, Novello V, Gomez JGC. Optimization of PHA production by pseudomonas using 13C-Metabolic flux analysis [Internet]. Proceedings. 2018 ;[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://www.aiche.org/conferences/aiche-annual-meeting/2018/proceeding/paper/188ay-optimization-pha-production-pseudomonas-using-13c-metabolic-flux-analysis

  • Dissertação (Mestrado)

    Desenvolvimento de uma ferramenta computacional para a análise de fluxos metabólicos empregando carbono marcado (2017)

    Oliveira, Rafael David de ; Carrillo Le Roux, Galo Antonio (Orientador) ; Gomez, José Gregório Cabrera (coorient)

    Unidade: EP

    Subjects: PSEUDOMONAS, METABOLISMO, ANÁLISE DE DADOS

    Acesso à fonteHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      OLIVEIRA, Rafael David de. Desenvolvimento de uma ferramenta computacional para a análise de fluxos metabólicos empregando carbono marcado. 2017. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2017. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3137/tde-05012018-091251/. Acesso em: 09 maio 2024.

    • APA

      Oliveira, R. D. de. (2017). Desenvolvimento de uma ferramenta computacional para a análise de fluxos metabólicos empregando carbono marcado (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3137/tde-05012018-091251/

    • NLM

      Oliveira RD de. Desenvolvimento de uma ferramenta computacional para a análise de fluxos metabólicos empregando carbono marcado [Internet]. 2017 ;[citado 2024 maio 09 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3137/tde-05012018-091251/

    • Vancouver

      Oliveira RD de. Desenvolvimento de uma ferramenta computacional para a análise de fluxos metabólicos empregando carbono marcado [Internet]. 2017 ;[citado 2024 maio 09 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3137/tde-05012018-091251/

  • Trabalho de evento-anais periodico

    Development of a computational tool for 13C- Metabolic Flux Analysis (2017)

    Oliveira, Rafael David de ; Nahat, Rafael Augusto Theodoro Pereira de Souza ; Taciro, Marilda Keico ; Gomez, José Gregório Cabrera ; Carrillo Le Roux, Galo Antonio

    Source: Anais do Simpósio Nacional de Bioprocessos. Conference titles: Simpósio Nacional de Bioprocessos. Unidades: BIOTECNOLOGIA, EP, ICB

    Subjects: METABOLISMO, MODELAGEM DE DADOS, MATLAB

    Acesso à fonteHow to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      OLIVEIRA, Rafael David de et al. Development of a computational tool for 13C- Metabolic Flux Analysis. Anais do Simpósio Nacional de Bioprocessos. Sao Paulo: Galoá. Disponível em: https://proceedings.science/sinaferm/sinaferm-2017/papers/development-of-a-computational-tool-for-13c--metabolic-flux-analysis-?lang=pt-br. Acesso em: 09 maio 2024. , 2017

    • APA

      Oliveira, R. D. de, Nahat, R. A. T. P. de S., Taciro, M. K., Gomez, J. G. C., & Carrillo Le Roux, G. A. (2017). Development of a computational tool for 13C- Metabolic Flux Analysis. Anais do Simpósio Nacional de Bioprocessos. Sao Paulo: Galoá. Recuperado de https://proceedings.science/sinaferm/sinaferm-2017/papers/development-of-a-computational-tool-for-13c--metabolic-flux-analysis-?lang=pt-br

    • NLM

      Oliveira RD de, Nahat RATP de S, Taciro MK, Gomez JGC, Carrillo Le Roux GA. Development of a computational tool for 13C- Metabolic Flux Analysis [Internet]. Anais do Simpósio Nacional de Bioprocessos. 2017 ; 1-4.[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://proceedings.science/sinaferm/sinaferm-2017/papers/development-of-a-computational-tool-for-13c--metabolic-flux-analysis-?lang=pt-br

    • Vancouver

      Oliveira RD de, Nahat RATP de S, Taciro MK, Gomez JGC, Carrillo Le Roux GA. Development of a computational tool for 13C- Metabolic Flux Analysis [Internet]. Anais do Simpósio Nacional de Bioprocessos. 2017 ; 1-4.[citado 2024 maio 09 ] Available from: https://proceedings.science/sinaferm/sinaferm-2017/papers/development-of-a-computational-tool-for-13c--metabolic-flux-analysis-?lang=pt-br
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